ImageJ 下載資訊

軟體簡介:

ImageJ是一個基於java的公共的圖像處理軟件，它是由National Institutes of Health開發的。可運行於Microsoft Windows，Mac OS，Mac OS X，Linux，和Sharp Zaurus PDA等多種平台。其基於java的特點， 使得它編寫的程序能以applet等方式分發。

ImageJ能夠顯示，編輯，分析，處理，保存，打印8位，16位，32位的圖片， 支持TIFF, PNG, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS等多種格式。ImageJ支持圖像棧功能，即在一個窗口里以多線程的形式層疊多個圖像， 并行處理。只要內存允許，ImageJ能打開任意多的圖像進行處理。除了基本的圖像操作， 比如縮放，旋轉， 扭曲， 平滑處理外，ImageJ還能進行圖片的區域和像素統計， 間距，角度計算， 能創建柱狀圖和剖面圖，進行傅里葉變換。

ImageJ是一個開放結構的軟件， 支持用戶自定義外掛程式和宏。

ImageJ自帶編輯器， 並且導入了java的編譯器，實現了簡單的IDE功能， 用戶可直接基於ImageJ進行圖像處理。

ImageJ的原始碼提供免費[1]。

ImageJScreenshot.png

這套軟體的特色

  • 免費！
  • 跨平台執行：因為它是架構在Java平台上。不管是Linux還是Mac或是Windows都可以執行。
  • 開放原始碼：由美國國家衛生院(NIH)所發展的軟體，屬於公有領域 (Public Domain)。
  • 強大社群支持：有許多使用者和程式設計者不斷發展程式的延伸。
  • 支持巨集Macros：可以藉此自動化執行程式
  • 有許多超過300個的Plugin
  • 處理速度快
  • 支援許多檔案格式

 

這個網站提供非常多的ImageJ教學
請參考：http://a-chien.blogspot.com/search/label/ImageJ。

打開軟體，再開啟要分析的圖片(File->Open)。

 



 























step 3.

設定分析影像的閾值(Image->Adjust->Threshold, 或快捷鍵Ctr+Shift+T)



























step 4.

調整閾值再按set決定。























step 5.

選擇analyze particle(Analyze->Analyze particle)
並且記得要選擇summarize，才會有分析的結果。

























step 6.
分析結果，可以看到原圖像的視窗會出現電腦判讀的數據，summary會顯示個數及分析影像的區域大小


 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

以下是一些教學範例
測量蝴蝶翅膀面積(日文)
http://www.geocities.jp/solenogyne/kisojikken-text2.pdf

葉面積測量和細胞計數(英文)
http://rsb.info.nih.gov/ij/docs/pdfs/examples.pdf

自行車角度測量(日文)
http://thinkbasis.net/jp/main_news.0.html?&tx_ttnews%5Btt_news%5D=39&tx_ttnews%5BbackPid%5D=6&cHash=fb06242c60

跑膠分析(英文)
http://www.mun.ca/biology/dinnes/B2250/Lab2/ImageJ.htm
http://www.twu.edu/exphys/pdf%20files/Gel%20Analysis%20of%20Lipoprotein%20Particle%20Diameter%20and%20Distribution%20Using%20ImageJ%201.35a.pdf

花粉測量(簡體中文)
http://www.planta.cn/forum/viewtopic.php?t=3898

測量細胞(英文)
http://naranja.umh.es/~atg/tutorials/VGIV-MeasuringCellsImageJ.pdf

細菌與病毒的計數(英文)
http://links.baruch.sc.edu/scael/notebook/imagej_counts/counts.html#1


http://www.uhnresearch.ca/facilities/wcif/imagej/

Plugin下載
http://rsb.info.nih.gov/ij/plugins/index.html
http://ij-plugins.sourceforge.net/
http://bij.isi.uu.nl/
http://www.optinav.com/imagej.html
http://www.dentistry.bham.ac.uk/landinig/software/software.html
http://www.mcdb.ucla.edu/research/hartenstein/software/imagej/index.html
http://www.gcsca.net/
http://www.ini.unizh.ch/Eacardona/trakem2.html

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